Im Laufe der fast 100jährigen Geschichte hat sich der St. Johannis-Zweigverein immer schnell zeitgemäße Strukturen gegeben und so erreicht, stets ein attraktives Angebot für das soziale Miteinander im Stadtteil Schweinheim zu schaffen.
Das betrifft auch die Führung des Vereins. In den Anfangsjahren war stets der Pfarrer von Maria Geburt der Vorsitzende, sein Stellvertreter der Bürgermeister der damals selbständigen Gemeinde Schweinheim.
Heute wählen die Mitglieder alle vier Jahre den ehrenamtlich tätigen Vorstand, dem in der aktuellen Wahlperiode sieben Mitglieder angehören. Eine festangestellte Verwaltungsleiterin ist für die organisatorischen Belange zuständig.